El primer script

Existen dos formas de utilizar código JavaScript en nuestros proyectos web:

1ª.- Incrustado dentro del archivo HTML

a) En la cabecera (head),
utilizando la etiqueta script.

b) En cualquier lugar del cuerpo (body),
  utilizando también la etiqueta script.

c) En un evento de un elemento:
en el propio evento o llamando a una función JS

2ª.- Desde un archivo externo, enlazado previamente

Utilizando la etiqueta script vacía, pero con el atributo src para enlazar un archivo externo con extensión .js

Observación: el orden de colocación del código JS dentro de un archivo HTML importa. Es decir, no podemos, por ejemplo, cambiar mediante JS alguna caracteriística de un elemento de la página si antes no se ha cargado dicho elemento.

Ejemplo:

// Archivo codigo.js externo
document.write('Hola mundo desde un archivo externo');

Salida, en el navegador: